Muzakarah Jawatankuasa Fatwa Majlis Kebangsaan Bagi Hal Ehwal Ugama Islam Malaysia Kali Ke-74 yang bersidang pada 25-27 Julai 2006 telah membincangkan tentang aliran pemikiran liberal, hukum dan implikasinya kepada Islam di Malaysia. Muzakarah telah memutuskan bahawa Gerakan Pemikiran Liberal mengandungi fahaman yang didapati menyeleweng dari aspek akidah dan syariah. Sungguhpun Majlis Fatwa Kebangsaan telah membuat keputusan tentang pengharaman Gerakan Pemikiran Liberal ini, ia sebenarnya masih menjadi satu ancaman dan cabaran kepada umat Islam sama ada di Malaysia atau di mana-mana sahaja. Justeru, kajian ini bertujuan untuk mengenal pasti ancaman pemikiran Islam Liberal di Nusantara dengan memfokuskan kepada isu-isu yang diketengahkan dan beberapa isu yang menjadi daya penarik kepada masyarakat Islam setempat untuk terpengaruh bersama mereka sekalipun jelas menyimpang dari ajaran yang sebenar. Metode yang digunakan adalah metode kajian kepustakaan. Dapatan kajian menunjukkan ancaman pemikiran Islam liberal yang dilontarkan dalam masyarakat mampu menarik khalayak serta mendapat tempat dalam kalangan segelintir masyarakat untuk turut terpengaruh dengan pemikiran Islam liberal. Tindakan pencegahan susulan perlu dilaksanakan secara terancang kerana impak secara jangka panjang mampu memberi kesan yang membimbangkan kepada umat Islam di rantau ini.